El IES Alpajés, es un Centro Público dependiente de la Comunidad de Madrid, autorizado para impartir los cuatro cursos de la etapa de Educación Secundaria Obligatoria, los dos cursos de Bachillerato en las modalidades de Ciencias y Humanidades y Ciencias
Sociales, y Formación Profesional con Formación básica y Ciclos de Grado Medio y Superior de la familia profesional de Hostelería y Turismo y de Industrias Alimentarias.
Inicialmente su configuración oficial era de un centro de Formación Profesional de las especialidades de “Agraria” y “Hostelería”.
· En el curso 91-92 se añadió la especialidad de Administración.
· En el 93-94 se cierra la especialidad de Administración. Este curso es uno de los más significativos en la historia del instituto, puesto que adelantando el calendario de aplicación de la L.O.G.S.E se implanta el tercer curso de la E.S.O comenzando a ser un centro de secundaria además de continuar con las enseñanzas de F.P .Este cambio fue especialmente difícil pues en Aranjuez existía ya un instituto treinta años más antiguo y con una sólida tradición como instituto de bachillerato.
· En el curso 94-95 contábamos con 3º y 4º de E.S.O y  F.P de Hostelería y el resto de la especialidad de Administración.
· En el 95-96 se implantan los primeros ciclos de grado medio de Cocina, y el de Servicio de Restaurante y Bar, así como 1º de Bachillerato.
· En el 96-97 se continúan implantando los cursos de 1º y 2º de Bachillerato de las tres modalidades; y los Ciclos de Grado Superior de “Restauración” y de “Información y Comercialización Turística”.
· En el curso 97-98 comienzan los cursos de 1º y 2º de E.S.O; un ciclo de grado medio de “Panadería y Pastelería”, así como dos programas de Garantía Social “Ayudante de cocina” y “Ayudante de Restaurante y Bar”.
· Desde el 2005 al 2016 el Centro participa en los Campeonatos Escolares de la Comunidad de Madrid.
· En el curso 2016-2017 el IES Alpajés se convierte en un Instituto Promotor de la Actividad Física y el Deporte.
· Desde el curso 2011-2012 hasta la actualidad se está desarrollando el Programa de Refuerzo y Apoyo Académico de la Comunidad de Madrid para alumnado de ESO.
· En el curso 2012-2013 comenzamos a funcionar como Instituto bilingüe de la Comunidad de Madrid con dos grupos de sección en 1º de ESO.
· En el curso 2016-2017 se amplía el proyecto bilingüe a bachillerato y se comienzan a impartir el CGM de Panadería, Repostería y Confitería en la modalidad Dual.
· En el curso 2017-2018 se nos concede un Proyecto de Innovación Pedagógica para desarrollar en los siguientes 3 cursos.
· En el curso 2019-2020 se inicia el los estudios de FP Básica de Actividades de Panadería y Pastelería, así como el Proyecto Propio de Doble Titulación en modalidad Dual de los Ciclos de  Técnico Superior en . Guía, Información y Asistencias Turísticas y Agencias de Viajes y Gestión de Eventos

El I.E.S Alpajés ha ido forjándose una identidad propia, como institución educativa, a partir del esfuerzo continuado de sus profesores que han marcado un itinerario pedagógico basado en unos principios y unas actuaciones que le distinguen de las actividades propuestas por otros centro de la localidad y que podemos articular en torno a seis pilares:

•  Oferta educativa variada y rica, proyectada sobre el conocimiento del entorno a través de una gran diversidad de actividades extraescolares y complementarias.
• Voluntad de internacionalización que pretende ampliar el horizonte vital y educativo de los alumnos a través de intercambios con países europeos y americanos.
•  Preocupación por los problemas de convivencia, organización de actividades como modo de prevención de los conflictos, integración del alumnado de otras nacionalidades y búsqueda constante de nuevas estrategias para atender a la diversidad.
• Reflexión sobre la práctica docente, evaluación de las tareas educativas, con el fin de mejorar la eficacia de la docencia. Proyectos de de innovación e investigación.
• Importancia de las TIC para integrar el uso de las nuevas tecnologías en el desarrollo cotidiano de la actividad docente.
• Proyectos de solidaridad con los países desfavorecidos. El objetivo de estos proyectos y las actividades que conllevan es sensibilizar a nuestros alumnos acerca de las carencias y necesidades de otras gentes que no gozan de los recursos de los que dispone el llamado “primer mundo”.